В РФ пытаются найти способ повлиять на КОВИД на уровне молекул
Ученым Самарского ГТУ удалось впервые смоделировать на компьютере трехмерную структуру белка-хеликазы, который отвечает за размножение коронавируса. Благодаря этой уникальной разработке теперь представляется реальная возможность целенаправленного воздействия на данный белок на молекулярном уровне. В частности, поиска малых молекул-ингибиторов, способных блокировать его активность и тем самым прерывать вирусный цикл размножения. Исследователи считают, что в дальнейшем, при детальной проработке этого научного направления и успешном поиске соответствующих ингибиторных соединений, может быть создан эффективный противовирусный препарат для лечения тяжелых форм Covid-19. Результаты данной работы уже представлены в печати.
О чём речь?
Учёные СамГТУ смоделировали на компьютере структуру определённого класса ферментов — хеликаз, который играет ключевую роль в размножении коронавирусов. Хеликазы представляют собой универсальные ферменты, способствующие репликации любых вирусов путём разделения двух цепей молекул ДНК и РНК. В частности, один из хеликаз нового коронавируса отвечает за его интенсивное распространение в организме человека.
Получив на основе этой модели возможность целенаправленного вмешательства в работу данного фермента, исследователи стремятся разработать эффективные молекулярные ингибиторы, блокирующие его активность и прерывающие вирусный процесс репликации, что позволит в дальнейшем создать новый препарат против COVID-19.
Комментарии учёных
Вадим Ширяев, доцент СГТУ, сообщил, что одним из ключевых этапов жизненного цикла коронавируса является воспроизведение генетического материала вируса. По мнению учёного, детальное понимание молекулярных механизмов действия данного фермента позволит в перспективе значительно упростить поиск перспективных медикаментов, способных результативно бороться с COVID-19 путём блокирования жизненно важных для вируса процессов.
Вадим Ширяев дополнил, что на данный момент единственным подтверждено эффективным оружием, способным справиться с возбудителем, стали вакцины. Однако при этом у них есть ряд ограничений в виде противопоказаний и возможных побочных эффектов, что ставит под сомнение их универсальность. Кроме того, специалист отметил, что остается дискуссионным вопрос об эффективности существующих средств, которые применяются в рамках терапии больных. На взгляд учёного, разработка новых эффективных противовирусных лекарств, действующих на уровне конкретных молекулярных механизмов, важна для полноценной терапии. Изучение механизмов действия ферментов-мишеней, таких как хеликаза, является актуальной задачей.
Учёные отмечают, что сконструированная модель является упрощенным математическим описанием его структуры, необходимым для проведения первичного анализа поведения данного фермента. Благодаря этой модели удаётся проследить изменения конформации хеликазы к связыванию с потенциальным ингибитором на молекулярном уровне. Исследователи подчеркнули, что подобные вычислительные модели позволят в дальнейшем на основе компьютерного моделирования предсказывать поведение комплексов белок-ингибитор и таким образом ускорить поиск перспективных молекул для изготовления новых противовирусных препаратов.
Специалисты высоко оценивают потенциал исследования. Они также указали, что подобный проект был развёрнут на уже выданный грант. И исследователи стали получать ощутимые результаты.